|
BY-503 Statistical Methods in Biology
The aim
of the course is to consider various basic statistical techniques in
conjunction with some experimental designs to those who are interested
in Biological experimentation. Statistical tests which are frequently
used in biological research are dealt without the need of comprehensive
mathematics. Among the subjects covered during the course are the
normal, binomial and Poisson distributions, calculating probabilities,
hypothesis testing, two group experimental design, transformations,
student's t-test, chi-squared test, analysis of variation and parametric
tests such as Wilcoxon test, sign test, rank correlation etc.
BY-505 Freshwater Pollution Ecology
The
ecology of certain freshwater invertebrates, their physiological and
behavioral responses under the stress of pollution, the use of these
organisms as pollutions indicator organisms are given in the light of
current literature. The main pollutant groups dealt are heavy metals,
chemical wastes, radio-active wastes and pesticides. Among the major
animal groups covered are Protozoans, Decapoda, Mollusca and Insecta.
BY-509 Anaerob Biyolojik Atıksu Arıtma Teknikleri
Organik
bileşiklerin anaerob koşullarda fermantasyon yoluyla parçalanması ve
çeşitli aşamalarda etkinlik gösteren mikroorganizma grupları.
Biyoteknolojik önemi olan ara ve son ürünler, organik bileşiklerin
eliminasyon yüzdeleri ve biyogaz verimi.
BY-513 Bitki Taksonomisi
Taksonomi nedir. Taksonominin önemi ve değişik taksonomi tipleri.
Linnaean taksonomisi ve öncesi, Devessieu ve doğal sistemler, filogeni
üzerine oturtulmuş sistemler, Engler Bessey ve diğer sistemler. Bitki
taksonomisi birimleri ve gelişimi, Nomenclatür'ün bitki taksonomosindeki
rolü. Latince isimlendirmenin önemi ve bitkilerin tanımlanmasında
kullanılan kriterler.
BY- 515 Atıksu Biyolojisi
Yüzey
sularında ve kirlilik düzeyine bağlı olarak doğası değişmiş sularda
indikatör mikroorganizmaların, zooplankton ve fitoplanktonların
oluşturdukları tablolar ve atıksu arıtma tesislerinde biyokütleyi
oluşturan organizma topluluklarının verim açısından değerlendirilmesi.
BY-517 Böcek Beslenme Fizyolojisi
Metamorfoz, besin rezervleri ve simbiyotik mikroorganizmaların
böceklerin besinsel gereksinimlerine etkileri; Beslenme prensipleri ve
böceklerin kalitatif besinsel gereksinimleri; Besin maddelerinin
kullanımı ve fonksiyonları.
BY-521 Fizikokimyasal Arıtma Tekniklerinin Biyolojik
Arıtmada Uygulanmaları
Aerob
ve anaerob biyolojik arıtma tesisine gelen atıksuların arıtma
verimlerinin arttırılması, nötralizasyon ve detoksifikasyonu ile
biyolojik dengelerin korunması amacıyla fizikokimyasal yöntemlerle ön
işleme sokulmaları ve uygulanabilecek yöntemlerin çıkış suları
kalitesine etkisi.
BY-527 Böcek Sentetik Besinleri ve Hazırlama Teknikleri
Meridik
ve Holidik besin kavramları, besin bileşenlerini hazırlama teknikleri,
Laboratuar koşullarını hazırlama yöntemleri ve deney materyalinin
sterilizasyonu, böcekler için geliştirilmiş holidik ve meridik
besinlerin karşılaştırmalı olarak analizi, sentetik besinler ile ilgili
bazı genellemeler.
BY-529 Su Omurgasızları
Tatlı
su ve deniz ortamında yaşayan omurgasız hayvan guruplarından Protozoa,
Porifera, Coelenterata, Ctenophora, Rotifera, Crustacea, Mollusca ve
Echinodermata'ların anatomik ve morfolojik özellikleri ile
sistematikteki yerleri incelenecektir.
BY-531 Bitkilerde Preparasyon Tekniği ve Uygulamaları
Bitkisel örneklerin alınması, fikse etme ve materyalin saklanması.
Boyama metotları, geçici ve daimi preparat yapımında değişik metotlar
ile geçici ve daimi kapatma ortamları. Mikroskopta ölçme, kesit alma ve
maserasyon yöntemleri hakkında bilgi verilecektir.
BY-533 Biosfer ve Noosfer I
Biosfer
ve özellikleri; enerji döngüleri; besin zincirleri; ekosistemde madde
dolaşımı, primer prodüktivite, ekolojik piramitler; ekosistemlerin
etkinliği, sekonder prodüktivite, biyosferdeki bozulmalar
BY-535 PAGE Elektroforez Teknikleri ve Uygulama Alanları
Natif
jel teknikleri ,gradient jel teknikleri, slab jel teknikleri, SDS slab
ve gradient teknikleri, izoelektrik fokuslama yöntemleri, iki boyutlu
akrilamid jel teknikleri, prensip ve uygulamaları.
BY-537 Bitki ve Bitki Toplulukları ile Ekoloji Faktörlerin İlişkileri
Öncül
bitkiler, süksesyon ve klimakslar sonucu oluşan bitki toplulukları,
bitki topluluklarının strüktürü ve sınıflandırılması, primer sekonder
vejetasyonlar, periyodik olan veya olmayan iklim, toprak ve biyotik
faktörler, bu faktörler ile bitki türü, bitki populasyonu ve bitki
birlikleri arasındaki ilişkiler, bu ilişkilerin ekosistem kavramı
içerisinde değerlendirilmesi, elde edilen değerlerin uygulamada
kullanılabilirliği, uygulamada ekolojik faktörlerin önemi ve ekolojik
problemler.
BY-539 Çimlenme Ekolojisi
Giriş
(tanım ve çimlenmeyi kontrol eden faktörlerin genel değerlendirilmesi),
Klimatik faktörler (sıcaklık ve önemi, sıcaklığın dormansi ile ilgisi,
dormansinin kırılması). Hidrik faktörler (tuzlu ve tuzsuz topraklarda
toprak suyu, yağışlar, nem ve dormansi), ışık ve etkileri. Toprak
faktörleri (toprak strüktürü ve tekstürü, toprağın kimyasal bileşimi,
toprak havası, CO2, pH ve bazı iyonların etkisi). Biotik faktörler (inhibitörler,
kök salgıları, simbiyotik çimlenme, biotoptaki canlıların etkisi
(mikroorganizmalar., bitkisel fauna, insan)
BY-543 Marine Fisheries
The
main topics covered during the course are; production cycles, migration
and food webs in the sea, the age structure of fish populations,
population dynamics, fish farming, regulation of fisheries and biology
of some economically important fish species.
BY-545 Çöller ve Çöllerde Yaşam
Çöl
kavramı, çöllerin genişlemesi, iklimi, morfolojik yapısı, çöl ikliminin
biyolojik etkileri, bitki yaşamı ve özellikleri, çöllerin geleceği ile
ilgili görüşler.
BY-547 Tatlı Su Ekolojisi
Tatlı
su ekolojisi: Tatlı su ortamın sınıflandırılması, tatlı su
organizmalarının ekolojik sınıflandırılması, ekolojik faktörler ve
organizmalara etkileri, pelajik bölgenin canlı toplulukları, bentik
bölgenin canlı toplulukları
BY-549 Bitki Ekolojisinde Araştırma Yöntemleri
Bitki
ve toprak örnekleri alımı, analize hazırlanması ve fiziksel ve kimyasal
analizleri.
BY-551 Böceklerde Üreme Fizyolojisi
Böceklerde erkek ve dişi üreme sistemleri; oogenez ve ovipozisyon;
çiftleşme ve döllenme, döllenme verimliliğini kontrol eden faktörler;
hibernasyon ve diyapoz; üremede özel şekiller.
BY-553 Vitamin Metabolizması
Vitaminlerin hormon ve enzimlerle ilişkileri; Vitamin noksanlığı ve
fazlalığına bağlı semptomlar; vitaminlerin sınıflandırılmaları,
metabolik işlevleri ve biyosentezleri.
BY-561 Heavy Metal Pollution in Aquatic Environment
The
course deals with the sources of metal accumulation in water bodies,
effects of some physical and chemical environmental factors on metal
toxicity and the effects of essential and nonessential metals on some
physiological, biochemical and behavioral responses of aquatic organisms.
BY-563 Tek Hücre Protein Üretimi
Tek
hücre proteini üretiminde kullanılan mikroorganizmalar (bakteriler,
mantarlar, mayalar ve algler), protein üretiminde kullanılan substratlar,
değerlendirilemeyen çeşitli atık maddeler, üretim teknolojileri,
mutasyonlar ve genetik madde transfer yöntemleri kullanılarak mutant suş
üretimi, tek hücre proteininin özellikleri, insan ve hayvan sağlığı
açısından önemi ve kullanım alanları.
BY-565 Deniz Zooplanktonları
Deniz
ortamındaki zooplanktonların sınıflandırılması, deniz zooplanktonlarının
biyolojik ve ekolojik özelliklerinin incelenmesi ve Akdenizde bulunan
zooplankton türleri ele alınacaktır
BY-573 Metals and Their Compounds in the Environment
In this
course various aspects of metals in the environment such as occurrence,
analysis and biological relevance will be given in details. The topics
of subjects which will be studied are the physical and chemical
properties, analytical methods, sources, production, important compounds,
uses, waste products, recycling, distribution of metals in the
environment and in food and in living organisms. The course will include
uptake, absorption, transport, distribution, metabolism and elimination
of metals in animals and humans. Bioindicators for monitoring metals in
the environment are also the concern of this course, as well as
metallothioneins which are low molecular weight metal-binding proteins
induced in relation to metal exposures.
BY-577 Genetik Madde Transferinde Kullanılan Vektörler
Bu
alanda kullanılan vektörlerin özellikleri, büyüklükleri, vektör tipleri
ve vektör üretimi konuları işlenecektir.
BY-583
Molecular, Biochemical and Cellular Perspectives of Aquatic Toxicology
In this course, toxic
effects of xenobiotics such as heavy metals and pesticides in the
aquatic environment will be studied considering their molecular,
biochemical and cellular perspectives in aquatic animals, particularly
in fish. The subjects covered in this course will be as follows;
enzymology and molecular biology of xenobiotic-conjugating enzymes,
biochemistry and molecular biology of monooxygenases, modulation of
blood cell-mediated oxyradikal production, cellular responses in chronic
toxicity, expression of oncogenes and tumor suppressor genes,
pathobiology of chemical-associated neoplasia, DNA adduct analysis and
mechanisms of metal regulation. Use of physiologically based
toxicokinetic models in a mechanistic approach to aquatic toxicology is
also one of the subject which will be investigated in this course.
BY-587 Bitki Hormonları ve Diğer Büyüme Regülatörleri
Hormon
nedir; gen aktivitesinde hormonların rolü. Oksinler; sentez ve yıkımı,
taşınımı, oksinlerin ekstraksiyonu ve ölçümü; Oksinler ve herbisitler.
Gibberellinler ve metabolizması, çimlenme dormansi ve büyümeye etkisi.
Sitokininler, metabolizması, sitokinin sentezi ve taşınması, organ
yapıcı ve hücre bölünmesine etkisi; Gövde ve kökte sitokininlerin
etkisi; klorofil sentezi ve kloroplast gelişmesine sitokininlerin
etkisi; İnhibitörler. Absisik asit ve etilen sentez ve bitkilerdeki etki
mekanizması. Salisilik asit ve turgorluluk, poliaminler ve diğer büyüme
engelleyiciler.
BY-591 DNA Elektroforezi ve Agaroz Jel Tekniği
Elektroforez teknolojisinin gelişme aşamaları ve agaroz yardımıyla
protein ve DNA'nın bileşenlerine ayrılması. Agaroz jellerin yapısı,
elektroforez karakteristikleri, analitik ve preparatif elektroforez
uygulamaları ve immun elektroforezde agar tekniğinin rolü.
BY-593 Mikrobiyoloji Laboratuvar Teknikleri
Sterilizasyon yöntemleri, aerob, anaerob ve fakültatif anaerob kültür
teknikleri, saf kültür izolasyon yöntemleri, antibiyotik hassasiyet
testleri, gıda (su, içecek ve yiyecekler) maddelerinden, göllerden,
denizlerden ve nehir sularından mikroorganizma izolasyon ve
identifikasyon yöntemleri.
BY-597 Çevre Kirlenmesinin Bitkiler Üzerindeki Etkileri
Çevre
kirlenmesi; tanımı, sınıflandırılması. Termal kirlenme, kimyasal
kirlenme, endüstriyel kirlenme ve radyoaktif kirlenmenin bitkiler
üzerindeki etkileri. Doğal alanların yanlış kullanımı; Tarımsal arazi
kazanma, yasa dışı kesim ve söküm, monotipik ve ekzotik plantasyonlar,
otlatma, yerleşime açma ve turizmin bitki ve bitki örtüleri üzerine
etkileri.
BY-599 Parazitoidlerde Parazit-Konak İlişkileri
Parazitin konak seçimi, değişik konaklardaki gelişme süresi, cinsiyetler
ve çıkış oranı, yumurta bırakma davranışı, konak şeklinin ve yapısının
etkileri, kokonun etkisi, konak büyüklüğünün etkisi, parazitleme gücü,
yumurtlama süresi, yumurtaların açılma oranı, parazit ömrü.
BY-605 Pestisit Biyokimyası
Pestisitlerin sınıflandırılmaları; Pestisitlerin absorbsiyonları,
metabolize edilmeleri, atılımları ve metabolitleri; Biyoakümülasyon;
Biyokonsantrasyon faktör, lipitde çözünürlük, suda çözünürlük; Partisyon
katsayısı, suda çözünürlük ve biyokonsantrasyon faktör arasındaki
ilişkiler, akut toksisite, biyokimyasal özellikler ve biyokonsantrasyon
faktör arasındaki ilişkiler, lipofilik bileşikler, biotransformasyon.
BY-609 Faj Ekolojisi
Bakteri
virüslerinin temel özellikleri ve tarihçeleri, bakteriyofajların
taksonomileri, dağılımları, tatlı sulardaki fajların ekolojisi, deniz
sularındaki fajlarının ekolojisi, atık su arıtma tesisleri ve sulardaki
bakteriofajların sonları, fekal kirliliğin göstergesi olarak,
Cyanofajlar, faj ekolojisindeki metotlar ve besinlerdeki bakteriofajlar
anlatılacaktır
BY-611 DNA Klonlama ve Gen Kütüphaneleri Hazırlanması
Moleküler klonlamada yaygın olarak kullanılan önemli ligaz, polymeraz,
transferaz, transkriptaz, endonükleaz ve exonükleaz gibi enzimlerin
davranışları ve restrüksiyon endonükleazlarında tanıma sequensleri
bulunan Class II endonükleazlarının başlıcalarının tanıma sequensleri,
RFI ve RFII tipte süpercoil DNA moleküllerinin vektör olarak
kullanılabilirliği ve genlerin amplifikasyonu.
BY-617 Gen Biyoteknolojisi
PCR (Polimeraz Zincir
Reaksiyonu) teknolojisi kullanılarak genler veya spesifik cDNA’ların
izolasyonu, hibridizasyon teknikleri yardımı ile nükleik asitlerin
karakterizasyonu (kromozomal DNA, plazmid, faj, retroviral RNA ve mRNA),
RNA düzeyinde gen ekspresyonunun analizi, protein düzeyinde gen
ekspresyonunun analizi, rekombinant proteinlerin üretilmesi ve
saflaştırılması, gen indüklenmesine bağlı olarak yeni proteinlerin
identifikasyonu ve üretimi ve gen klonlanmasını içeren aşamalar
anlatılacaktır.
BY-619 Böceklerde Sindirim Metabolizması
Böceklerin besinsel
ihtiyaçları olan proteinler, karbonhidratlar, lipidler, vitaminler,
mineraller ve diğer besin bileşenlerinin enzimatik yolla tüm sindirim
sistemde nasıl metabolize oldukları, kullanılabilir ve kullanılamaz
tipteki besin bileşenleri ile ilgili konular.
BY-621 Türkiye’nin Sulak Alan Bitkileri Ve Vejetasyonu
Sulak alanın tanımı ve
ekosistem icerisindeki önemi, Türkiye’de yayılış gösteren bazı önemli
sulak alan bitkileri ve vejetasyonu. Bunların akuatik ortam şartlarına
anatomik ve morfolojik adaptasyonları. Sulak alan bitki örtüsünün,
ortamdaki suyun derinlik, tatlı, acı ve tuzluluk gibi özelliklerine
bağlı olarak sınıflandırılması.
BY-631 Gıda Katkı Maddelerinin Genotoksik
Etkileri
Gıdalarda kullanılan
antimikrobiyal maddeler, tatlandırıcılar, renk maddeleri, asit
düzenleyiciler ile bunların mutajenik, kanserojenik ve sitotoksik
etkileri.
BY-633 Su Toksikolojisi
Sudaki çeşitli kirleticilerden metaller,
pestisitler ve hidrokarbonlu bileşiklerin özellikleri, bunların su
canlıları tarafından alınmaları,birikimleri ve atılımları, su
organizmalarındaki letal ve subletal etkileri, su organizmalarının
dokularındaki birikimi ile canlılardaki davranış mekanizmalarına
etkileri incelenecektir.
BY-635 Fire Ecology In
Mediterranean Ecosystems
Introduction to adaptations of Mediterranean
plants to fire. Seed production and post-fire germination. Community
patterns following fire. Early post-fire herbaceous cover. Post-fire
development of the shrub cover. Post fire succession in different
habitats.
BY-637 Conservation Of
Natural Resources
The demand for natural
resources, the impact of climate change, biodiversity and species
extinction, the value of biodiversity. The meaning and role of the World
Heritage sites, Biosphere reserves, Botanical gardens, specially
protected areas, national parks, etc.
Discussion and explain
on some important international environmental agreements for protection
of species and habitats, marine and atmospheric pollution.
BY-639 Etnobotanik
Etnobotanik tanımı, insanlar ve bitkiler
arasındaki ilişkiler, geçmişte ve günümüzde bitkilerin kullanım
durumları, besin ve endüstri bitkileri, tıbbi bitkilerden örnekler,
botaniksel, ekolojik ve coğrafik özellikleri, sistematiklerinin
yapılması.
BY-641 Endüstriyel Enzimler Ve Kullanım
Alanları
Amilaz, Selülaz, Proteaz, Xylanase, Lipaz,
Kitinaz, Beta Laktamaz, Glikoamilaz gibi mikrobiyal kökenli enzimlerin,
üretimi, aktivitelerinin saptanması ve kullanım alanları anlatılacaktır.
BY-643 Mikrobiyal Enzim Biyoteknolojisi
Bu derste, mikrobiyal enzimler, enzim
üretiminde kullanılan teknikler, substratlar ve suşlar anlatılacaktır.
Rekombinant suş üretimi (Genetik transfer ve mutasyon teknikleri
kullanılarak), enzimlerin saflaştırılması ve uygulama alanları
anlatılacaktır.
BY-645 Mikrobiyal Enzim
Analiz Yöntemleri
Bu derste, Endüstriyel alanda kullanılan
mikrobiyal enzimler anlatılacaktır. Enzim çeşitleri, substrat
spesifiteleri, pH optimumları ve pH stabiliteleri, Sipesifik
aktiviteleri, Termal stabiliteleri, Enzim kinetiği, Relatif
aktivitelerinin saptanmasıyla ilgili konular anlatılacaktır.
BY-649 Transgenik
Organizma Üretimi Ve Teknolojisi
Bu derste, Biyoteknolıji için önemli
mikroorganizmaların sınıflandırılmaları ve üretimleri, Rekombinant DNA
teknolojisi yöntemi ile istenilen hedeflere dönük organizma üretimi,
Maya, Bakteri ve diğer organizmaların transgenik duruma getirilmesi ve
bunların ürünleri ile yararlanılma alanları, Gıda endüstrisi atıklarının
değerlendirilmesinde transgenik organizmaların kullanımı ve Genetik
değişikliğe uğratılmış mikroorganizmalar ve ürünleri hakkında bilgiler
verilecektir.
BY-651 İleri Hücre
Biyolojisi I
Yaşamın molekülleri, DNA, RNA, proteinler,
bağışıklık sisteminin moleküler temeli.
BY-653
Hayvansal Dokularda Mikropreparasyon Yöntemleri
Hayvansal dokularda preparat yapma
yöntemleri, total preparasyon yöntemi, kuru kapatma, froti yöntemi,
fiksasyon, çok kullanılan fiksatif karışımlar, dehidrasyon,
saydamlaştırma ve parafine gömme, parafin kesitlerin hazırlanması,
kesitlerin boyanması, boyanmış preparatların kapatılması
BY-655 Böcek
Fizyolojisi
İntegüment; Solunum, Dolaşım, Sindirim,
Boşaltım sistemleri; Gelişme, Üreme, Beslenme ve Metabolizma
Fizyolojileri
BY-657 The Aquatic Environments as Living Spaces
Through
this course the freshwater environment will be dealt on their physical
and chemical properties, ecology of the standing and flowing waters and
animal communities live in. The marine environment will also be dealt on
their physical and chemical properties, oceanic circulation and water
movement, plankton communities, oceanic nekton, the pelagic environment,
the benthic environment, intertidal ecology, estuaries and human impact
on the sea. This course will also include various kinds of pollution
problems in the aquatic environment which affects ecological needs of
aquatic animals.
BY-659 Ecophysiology
Effects of
the ecological factors on animal physioloy are the subjects of this
course. The main topics of this study will be the respiration, food and
energy metabolism, temperature effects and regulation, water and osmotic
regulation, excretion and hormonal control in different animal groups.
BY-661 Fungal Biyoteknoloji
Yüksek Mantarlarda meyva ve enzim
sentezine yönelik uygulamaların tanımı ve ortam, nem, ısı ve
oksijen-karbondioksit gereksinimlerinin incelenmesi ile, kitlesel
üretime yönelik teknolojik araştırmaların detaylı incelenmesi.
BY-663 Vejetasyon Dinamiği
Vejetasyonun oluşumuna ve değişimine
etki eden biyotik ve abiyotik faktörler, ekosistemlerin genel yapısı ve
işlevleri, süksesyon ve süksesyon çeşitleri, klimaks vejetasyonlar ve
klimaks çeşitleri, monoklimaks ve poliklimaksa dair çeşitli görüşler,
primer ve sekonder vejetasyonlar. Tüm bu konularla ilgili olarak arazi
çalışmaları yapılacaktır.
BY-665 Doğadaki Patojen Enterobacteriaceae Üyeleri I
Enterobacteriaceae
Familyasının özellikleri ve kompozisyonu, Hayvan ve insan sağlığı ve
hastalıklarıyla ilişkileri, Besin kaynaklı Enterobakteriyel patojenler
ve romatoid hastalıkları, Toksinleri, Bakteriyel invazyonun basamakları,
antibiyotikler ve diğer kemoterapotiklere direnç mekanizmaları.
BY- Moleküler Genetik I
Nükleik
asitler, DNA (DNA molekülünün yapısı, DNA formları, DNA’nın
denatürasyonu ve renatürasyonu), genetik materyal çeşitleri, DNA’nın
replikasyonu, replikasyon tipleri, RNA (RNA’nın yapısı ve RNA
çeşitleri), genin ekspresyonu, transkripsiyon, primer RNA’ların (pre-RNA)
modifikasyonu, genetik sözlük ve genetik kodun açıklanması, protein
sentezi (translasyon), protein (protein molekülü ve yapısı),
mutasyonlar, mutasyon çeşitleri, gen mutasyonunun sebepleri,
mutasyonların moleküler mekanizması, suni mutasyonlar, DNA zararlarının
onarılması (DNA’nın tamiri), mutasyonların suppresyonu (baskı altında
tutulması), genomdaki genlerin düzeni ve genomdaki değişmeler (rekombinasyon),
Eukaryotlarda rekombinasyon, virüslerde rekombinasyon, bakterilerde
rekombinasyon.
BY-.. Fitolojik Çeşitlilik
Floranın araştırılıp ortaya konulması, floristik bölge
endemizm durumlarının saptanması, floradaki tehlike sınıfları, bu
sınıfların tanımı ve sınıfların saptanma yöntemi.
BY-..... Akdeniz Ekosistemleri
Ekosistemin tanımı, ekosistemlerin ayrımını tayin eden
faktörler, yeryüzünde ve ülkemizde Akdeniz'in yeri, Akdeniz'in genel
ekolojik özellikleri ve başlıca ekosistemler bu sistemlerin varlığını,
dağılımını olumlu ve olumsuz yönde etkileyen faktörler.
BY..... Holobasidiomycetes’de Genetik Rekombinasyon Teknikleri
Ağırlıklı olarak kültüre alınmış
Holobasidiomycetes grubu
mantarlarda verim ve ortam gereksinimleri açısından ekonomik artışlar ve
kolaylıklar sağlanacak genetik manipülasyonların uygulama şekilleri ve
yeni rekombinantların verim açısından incelenmesi.
BY....
Bitkiklerde Oksidatif Stres
Oksijen
aktivasyonu,Radikal oksijenin biyolojik reaksiyonları, Lipidlerin
oksidatif tahribatı, Tipik peroksidasyon reaksiyonları, Bitki hücresi
memranında özel reaksiyonlar, Proteinlerin oksidatif yıkımı, DNA’nın
oksidatif yıkımı, Aktive edilmiş oksijen ürünleri bulunduğu yerler;
Kloroplast, Mitokondri, Endoplazmik retikulum, Küçük moleküller, Plazma
zarı, Hücre çeperi, Savunma mekanizması; Süperoksit dizmutaz, Katalaz,
Askorbik asit, Glutatyon, Takoferol, Koratinoid, Herbisit dirençliliği,
Herbisitlerin ışığa karşı hassasiyeti.
BY.... Kurak ve Yarı
Kurak Ekonomik Bitkilerin Ekofizyolojisi
Dünyanın
kurak ve yarıkurak alanlarının ekonomik bitkileri, dünyanın kurak ve
yarı kurak bölgeleri, Ekofizyolojisi, Bitki stresi ve Azot fiksasyonu,
Su sitresi, Sıcaklık stresi, Tuz stresi, Fotosentez; Karbon
reaksiyonları, C3,C4, CAM tipi fotosentez. Bitki metabolitleri, Anatomik
ve morfolojik adaptasyonlar seçilmiş kurak bölge bitkilerinin
ekofizyolojisi ve kullanılmaları.
BY-....
Salmonella/Mikrozom Test Sistemi
Salmonella typhimurium
test suşlarının genotipleri, suşların genotip kontrol testlerinin
yapılması, kültür ve master plaklarının hazırlanması, memeli
karaciğerinden mikrozom fraksiyonunun elde edilmesi, suşların
stoklanması, Ames mutajenite testinin yapılışı.
BY...Principles
and Techniques of Practical Biochemistry
General principles of
biochemical investigations; centrifugation techniques; Chromatographic
techniques; electrophoretic techniques; spectroscopic techniques;
radioisotope techniques; potentiometric, electrometric polarographic and
manometric techniques; recent advances in methodologies. Modern
instrumental techniques will be employed whenever appropriate.
BY..The
ATP Cycle and Cell Bioenergetics
The first and
second laws of thermodynamics; the concepts of entropy and free energy;
the chemistry of ATP; energy yielding and energy requiring cell
activities; phosphate transfer reactions; mechanisms of electron
transport and oxidative phosphorylation; regulation of ATP production
and other energy rich nucleosides. Effects of toxicants on electron
transport and oxidative phosphorylation
BY....Metabolic
Regulations
Principles of metabolic
regulation in mammalian systems. Metabolic control enzymes and pathway
fluxes in cells, tissues and the whole organism with emphasis on how
metabolic control of pathways changes in response to nutritional status.
BY....Global
Environmental Change
Physical, chemical,
biological and ecological dimentions of global environmental change;
the role of human activities in shaping and changing the environment
along with the discussions on the recent datas of the subject.
BY...Bitki Hücre Yapısı ve
Metabolizması
Bitki Hücresinin Yapı ve
Fonksiyonu, Bitki Hücresini Çalışma Yöntemleri, Hücre metabolizmasının
Düzenlenmesi, Hücre Organellerinin Yapı ve İşlevleri, Nukleus,
Plastitler, Mitokondri, Ribozomlar, Golgi Kompleksi, Endoplazmik
Retikulum vb. organellerde yapı, işlev ve biyokimyasal aktiviteler
BY...Akuatik ve Yarı Akuatik
Ortamlarda Bitki Yaşamı
Akuatik Bitkiler, Akuatik
Çevre, Su Altında Fotosentez, Akuatik Bitkilerde Büyüme, Gelişme ve
Deyişim, Besin Elementleri, Sıcaklık, Tuzluluk ve Su Hareketlerinin
Bitki Yaşamına Etkileri, Akuatik Bitkilerde Biyotik Etkileşimler, Yarı
Akuatik Bitkiler ve Suya Dayanıklılık, Tohum ve Fidelerde Oksijen
Stresi, Oksijen Stresi Altında Kök Fizyolojisi, Tüm Bitkinin Oksijen
Stresine Cevabı
BY...Ekolojik İndikatör
Olarak Algler
Tatlı su Elkosisteminde
İndikatör Algler, Deniz Ekosisteminde İndikatör Algler, Çevre
Kirleticilerin Alglere Etkileri, Su Kalitesinin Belirlenmesinde Algler,
Temiz Su Algleri, Kirli Su Algleri, Ağır Metal Düzenleyicisi Olarak
Algler, Algler ve Ötrifikasyon
BY...Biochemical Toxicology: Definition and
Scope
Introduction, Toxicology,
Biochemical Toxicology; General Description, Portals of Entry,
Distribution, Metabolism, Sites of Action, Excretion, Overview of
Molecular and Techniques.
BY..Conjugation and Elimination of Toxicants
Conjugation reactions,
Glycosides; Glucuronides, Sulfation, Methylation; N- Methylation, O-
Methylation, S- Methylation, Acylation; Acetylation, Amino Acid
Conjugation, Glutathione S-transferases; Allosteric Regulation,
Induction by Xenobiotics, Cystein S-Conjugate β-Lyase, Lipophilic
Conjugation, Phase II Activation, Phase III Elimination; MRP/MOAT, p-Glycoprotein
BY...Principles of Environmental Toxicology
Effects of Pollutants on
Ecosystems; An Introduction to Food Webs, Some Speccific Examples of the
Environmental Toxicities, Risk versus Benefit, Development of Safer
Chemicals, Environmental Toxicity Testing, Environmental Monitoring
BY...Ekotoksikoloji
Cevredeki toksik maddelerin organizmalara ekolojik etkileri, toksik
maddelerin canlilardaki biyokimyasal, immunoljik ve fizyolojik etkileri,
doğal toksinler ve çevre kirliliğin
belirlenmesinde
biyolojik göstergelerin kullanımı incelenecektir.
YLBY-201 / DBY-203
Uzmanlık Alan Dersi
Biyoloji Anabilim Dalında Enstitümüz tarafından Doktora tez programı
kabul edilen Doktora öğrencileri için danışman yönetiminde son
gelişmelerin ışığı altında araştırma ve inceleme sonuçlarının
değerlendirilmesi tartışılması. (tüm doktora öğrencisi bu programa diğer
Lisansüstü derslerde olduğu gibi yarıyıl başlarında kayıt yaptırmak
zorundadır.)
BY-500 Mikrobial Ekoloji
Ekosistemlerin başlıca mikroorganizma grupları, ekosistemdeki enerji
transferinde mikroorganizmaların rolü, elementlerin dönüşümlerinde
mikroorganizmaların etkileri, (biyolojik devirler: karbon, azot, kükürt,
fosfor, ve diğer elementlerin devirleri). karasal ekosistemlerde
mikroorganizmalarla diğer gruplar arasındaki etkileşimler (spermosfer,
rizosfer, fillosfer, ölü örtü ve etkileri).
BY-504 İleri Hücre Fizyolojisi
Hücre
bileşenleri ve görevleri; Hücrenin içinde bulunduğu çevre ile ilişkisi,
Hücre zarından madde iletimi; Osmoz filtrasyon ve difüzyon, pasif iletim
mekanizmaları, aktif iyon iletimi; Biyoelektrik potansiyeli, zar
potansiyelleri ve bunların oluşmasında pasif ve aktif mekanizmaların
rolü. Hücrenin aksiyon potansiyelleri ve buna ilişkin olaylar; Hücrede
cereyan eden anabolik ve metabolik reaksiyonlar.
BY-506 Bitki Toplama, Kurutma ve Herbarium Tekniği
Bitki
örneklerinin toplanmasında göz önüne alınacak hususlar, örneklerin
toplanma şekli, örnekleri etiketleme ve presleme sistemleri. Bitki
familyası, cins, tür, alt tür ,varyete ve form adlarının Latince yazım
kuralları. Bitki taksonomisi birimlerinde yer alan taksonomik adlarının
ifade ettiği anlamlar, bitki sinonimlerinde (Syn), endemiklerde ve tip (Type)
örneklerinde uygulanacak yöntemler.
BY-508 Marine Ecology
Environmental aspects of the sea, water circulation, and water movements,
physical and chemical aspects of the marine environment, tides and the
intertidal environment, the sea bottom, estuarine environment and
organic production in the sea are given through this course.
BY-510 Biyolojik Arıtmada Sistem Kombinasyonları
Aşırı
organik yüklü atıksularda en verimli arıtma teknolojilerinin bölgesel
iklim özellikleri de dikkate alınarak en ekonomik ilk yatırım ve işletme
giderleriyle arıtılabilirlikleri konusunda uygulanabilecek sistem
kombinasyonlarının seçimi ve mantığı.
BY-514 Biyolojik Arıtma Tesislerinde Çamur Problemi ve
Değerlendirme
Teknolojileri
Özellikle aerob biyolojik arıtma tesislerinde biyokütlenin işletme
verimi ve gereksinim fazlası aktif çamur kitlesinin kabul edilebilir
boyutlarda tutulabilmesiyle ilgili problemler, bunların modern
teknolojik çözüm yolları ve oluşan aktif çamur fazlasının ekonomik
olarak yok edilmesi veya doğaya geri döndürülmesi ile ilgili
geliştirilmiş modern uygulamalar.
BY-516 Doğaya Uyumlu Biyolojik Arıtma Teknolojileri
Özellikle kırsal alanda yüksek bitkiler aracılığı ile düşük yatırım
maliyetli decentral arıtma tesislerinin kurulması ve uygulanacak
parametrelerin değerlendirilmesi.
BY-520 Polinoloji (Polenbilimi)
Polenin
tanımı, yapısı, yüzey şekilleri ve özellikleri, Gymenosperm ve
Angiospermlere ait polen örneklerinin tanıtımı, polen preparatı
hazırlanışı, polen diyagramları ve yorumları, polinolojinin uygulama
alanları.
BY-522 Biyosfer ve Noosfer II
Noosfer
nedir, besin kaynaklarının azalması ve biosfer potansiyeli arasındaki
ilişkiler, nüfus patlaması ve göçlerin etkileri ve bununla ilgili çevre
düzenlemeleri; insanı nasıl bir çevre bekliyor, insan türü ve geleceği
hakkında somut veriler yardımıyla bilgiler aktarılacaktır.
BY-526 Toprak Biyolojisinde Araştırma Yöntemleri
Toprakta, potansiyel ve zenginleştirilmiş ortamlarda mikrocanlı
faaliyetleri (karbon ve azot mineralizasyonları) incelenecektir.
BY-528 Böcek Biyokimyası
Böceklerde homeostasis ve metabolizmanın ayırt edici özellikleri,
gelişmenin hormonal kontrolü, böcekler ve dış çevreleri; feromonlar ve
savunma maddeleri.
BY-530 Deniz Bentozu
Bentik
organizmaların toplanma metotları ile deniz ortamında bentik
organizmaların bölgesel ve mevsimsel değişimleri ve biyoekolojik
özellikleri incelenecektir. Ayrıca bentik organizmaların
sınıflandırılması, yaşam şekilleri, besin durumları, üremeleri ve
gelişimleri tartışılacaktır.
BY-534 Prokaryot ve Eukaryot Organizmalarda DNA İzolasyon Yöntemleri
Procaryot ve eucaryot organizmaların seleksiyonu, DNA izolasyonunda
kullanılan yöntemler ve uygulaması, izole edilen plasmidler ve DNA'nın
agaroz elektroforez tekniği ile separasyonu ve karşılaştırılması. Maya,
mantar ve farelerden DNA izolasyonları ve bunların Pulsed field tekniği
kullanarak separe edilmeleri.
BY-540 Environmental Pollution
Water
and air pollution; Solid wastes and radioactive pollutants; noise
pollution; Control of pests and weeds.
BY-544 Viroloji Teknikleri ve Doku Kültürü
Virüs
laboratuvarında yapı ve kullanım özellikleri; hayvan deneyleri ve
yumurta tekniği; doku kültürü ve kültür ortamı çeşitleri, nötralizasyon;
kompelement bağlanması; hemaglutinasyon ve hemaglutinasyon inhibisyonu
teknikleri.
BY-546 Rekombinant DNA Metotları
Ethidium bromide-cesium chloride yöntemiyle plasmid DNA larının
izolasyonu, ethidium bromide-cesium chloride solusyonundan DNA ların
saflaştırılması, DNA dan ethidium bromid’ın uzaklaştırılması, DNA nın
elektroforezinde seperasyonu, boyanması, RNA teknikleri, slab gellerde
DNA nın geri kazanılması, Saccaromycetes cereviciae, Pseudomonas
aeruginosa’da transformasyon ve gen klonlanması, in vitro mutasyon
teknikleri
BY-550 Marine Plankton
Methods
of plankton collection, sorting and quantitative estimation of
planktonic organisms, regional and seasonal characteristics of plankton
in marine environment are discussed.
BY-552 Sitogenetik
Bitkilerin karyotipi, mitoz bölünmeyi incelemek ve mitozdaki sitogenetik
anormallikleri saptamak amacıyla kök ucundan daimi preparatların
hazırlanması, polen ana hücresinde meios bölünmeyi incelemek ve
meiosdeki sitogenetik anormallikleri saptamak amacıyla anterlerden ezme
metodu ile daimi preparatların hazırlanması, insanda kromozom
aberasyonunu incelemek amacıyla insan kanından daimi preparatların
hazırlanması, kardeş kromatid değişimini (KKD=SCE) incelemek amacı ile
insan kanından preparat hazırlanması, insan kromozomlarında çeşitli
bantlama metotları, X ve Y kromatinini incelemek amacıyla preparat
hazırlanması.
BY-554 Böceklerde Karbohidrat Biyokimyası
Böcek
hemolenfinin ve dokularının karbohidrat içeriği, hemolenf şekerinin
barsak absropsiyonu ve fizyolojisi, böceklerde karbohidratların
kullanımı ve biyosentezi, karbohidrat metabolizması üzerine hormonal
etkiler, glikoproteinler ve kitin.
BY-560 Stomaların Yapı ve Mekanizmaları ve Fotosentez-Transpirasyon
İlişkileri
Stoma
anatomisi ve stoma hareketlerinin fizyolojik görünüşü, karbondioksit
konsantrasyonunun stomatal açılmadaki etkisi, uyarılmanın iletilmesi,
ışığa ve diğer faktörlere stomanın tepkisinde yer alan hipotezler ve
mekanizmalar. Koruyucu hücrelerde fotosentetik üretim. Nişasta-şeker
hipotezi, geçirgenlik hipotezi, karbondioksitin etki
mekanizması-karanlık fiksasyonu. Transpirasyonun rolü ve ölçümü,
ekosistemdeki bitkilerin enerji değişimleri.
BY-562 Planktonoloji
Planktonoloji: Planktonik türlerde beslenme, üreme, gelişme ve
fizyolojileri ile plankton populasyonlarının bölgesel dağılımları,
dinamiği, geçici değişimleri, birbiriyle ve ortamla ilişkileri,
planktonun besin zincirindeki yeri ve enerji transferindeki rolü,
fizikokimyasal değişikliklere uyumları, küme oluşturmaları ile
pollusyona ve pollutantlara karşı tepkileri incelenecektir.
BY-564 Prokaryot ve Eukaryot Organizmalar Arasında Gen Transfer
Yöntemleri
Organizmaların izolasyonu, genetik özelliklerinin saptanması için
gerekli testlerin yapılması, izole edilen DNA yapılarının konjugasyon,
transformasyon, füzyon ve elektrofüzyon yöntemleri kullanılarak
transferi.
BY-566 Moleküler Genetik II
Bakteri hücrelerindeki
plazmidler, bakterilerin atlamalı genleri ve transpozisyon,
Eukaryotlarda hareketli genetik elementler, retrovirüsler ve onkogenler,
Prokaryotlarda gen regülasyonu, virüslerde gen regülasyonu ve konak
hücrelerde virüslerin oluşması, Eukaryotlardaki genlerin yapısı,
ekspresyonu ve regülasyonu, moleküler genetik ve tıp, Thalassaemie’ler,
kollajen genlerinin yapısı, immun sistemin moleküler genetiği,
Eukaryotlarda ekstra kromozomal DNA’lar (mitokondri genomu ve kloroplast
genomu), bakteri, mitokondri, kloroplast arasındaki genetik benzerlikler
ve filogenetik ilişkiler, gen mühendisliği, DNA baz sıralarının
saptanması.
BY-572 Water Pollution and Fish Physiology
Physiological responses of fishes to various pollutants such as metals,
pesticides, detergents, polychlorinated biphenyls and petroleum
hydrocarbons in the aquatic environment will be given in this course.
The course will cover following metabolic effects of water pollutants;
respiratory and cardiovascular responses, hematology, osmotic and ionic
regulation, physiological energetics and, reproduction and growth.
Environmental hypoxia and uptake, accumulation, biotransformation and
excretion of xenobiotics are also the subjects which will be studied
here.
BY-574 Toxic Effects of Metals and Pesticides on Animals
This
course deals with the toxic effects of metals and pesticides in the
environment on animals including humans. The subjects covered throughout
this course will be the principles of toxicology and absorption,
distribution, excretion and biotransformation of metals and pesticides
in the metabolism. The course include the toxic effects these pollutants
on the blood, tissues and organs of animals. Factors influencing
toxicity of metals and pesticides are also the subjects which will be
given here.
BY-576 Sucul Ekosistemlerde Ağır Metallerin Etkileri
Tatlı
su ve deniz ortamına giren ağır metallerin kaynakları, bu metallerin
diğer faktörlerle olan etkileşimleri, sucul ekosistemlerde yaşayan
omurgasız ve omurgalı hayvanlarda özellikle balıklarda ağır metallerin;
alınımları, biyotransformasyonu, akümülasyonu ve toksik etkileri ile
bazı biyokimyasal parametreler üzerindeki etkileri incelenecektir.
BY-580 Bitkilerde Stres Tipleri ve Direnç Mekanizmaları
Stres
terminolojisi; stresin bitkilere zararı; stres direnci; su ve kuraklık
stresi; su stresi adaptasyonları ve korunma mekanizmaları; radyasyon
stresi tipleri ve zararları;, tuz stresleri ve diğer stresler. stres
tepkilerinin karşılaştırılması. genel stres tepkisi kavramı. direnç ve
zarar tepkilerinin karşılaştırılması.
BY-582 Türkiye’nin Flora ve Vejetasyon Yapısı
Flora
tarihçesi, flora ve vejetasyon oluşumunun ekolojik şartları, Türkiye
bitki örtüsünün geçirdiği evrim ve flora alanlarında değişmeler, Türkiye
Florası’nın kökeni ve paleoflorası, 10 ciltlik Türkiye Florası’nın
önemli özellikleri, yurdumuzun flora bölgeleri, endemizm ve endemik
bitkileri, vejetasyon formasyonları.
BY-584 Vejetasyon ve Anız Yangınlarının Ekolojik Etkileri
Vejetasyon ve anız yangınlarının karakteristik özellikleri, tarihçesi ve
çıkış nedenleri, denetimli yakma tekniği. Yangının toprak nemi,
tekstürü, mikrokliması, verimliliği ve kimyasal kompozisyonu (asitlik,
organik madde, azot, kalsiyum, fosfor, potasyum, minor elementler)
üzerine etkisi. Yangının canlı organizmalar (ilkel bitkiler, bitki
zararlıları, bakteriler, omurgasızlar, omurgalılar, bitki ve bitki
toplulukları) üzerine etkisi.
BY-586 Böceklerde Protein Metabolizması
Böcek
beslenmesinde önemli yer tutan temel ve temel olmayan amino asitlerin
sentezledikleri ve birbirlerine dönüşümleri, reaminasyon ve
transaminazların metabolik rolleri, keto asitlerin metabolizmasında yer
alan glukogenik ve ketogenik yolların metabolizması, aminasyon ve
deaminasyon olaylarının beraberinde yer aldığı protein metabolizması ile
ilgili spesifik konular.
BY-588 Bakteri Genetiği
Bakterilerin genetik yapılar, bakterilerde bulunan ekstrakromozomal
elemanlar ve bakteriyofajların genetik yapılar, bakteriler arasındaki
rekombinasyon olayları işlenecektir.
BY-592 Moleküler Biyoteknoloji
Moleküler biyoteknolojideki yenilikler, rekombinant DNA teknolojisi,
moleküler araştırma prosedürleri, Prokaryotlarda gen ekspirasyonunun
manipulasyonu, Eukaryotlarda heterolog proteinlerin üretimi, direk
mutagenecis ve protein mühendisliği konuları hakkında bilgi verilecektir
BY-594 Doğadaki Patojen Organizmalar
Canlılarda enfeksiyon oluşturan çeşitli bakteriyel etmenlerin
morfolojileri, fizyolojileri, virulensi, epidemiyolojisi, izolasyon ve
identifikasyonu.
BY-596 Çevre Mikrobiyolojisi ve Ekolojisi
Toprak,
su ve atmosferdeki mikroorganizmaların dağılımları ve ekolojisi
anlatılacaktır.
BY-598 Böcek Sindirim Fizyolojisi
Böceklerde sindirim kanalının anatomik organizasyonu, fonksiyonel
bölgeleri; Besin maddelerinin sindirim kanalında ilerlemesi; Enzim
aktivitesi ve besinin absorpsiyonu için gerekli şartlar ve bunları
sağlama mekanizması.
BY-606 Gıda Mikrobiyolojisi
Mikroorganizma gıda ilişkileri, gıdalarda indikatör ve patojen
mikroorganizmalar, gıda muhafaza ilkeleri, gıdalarda mikrobiyolojik
bozulmalar (patojen mikroorganizmalar ve muhafaza yöntemleri), gıda
güvenliği (biyolojik kriterler ve hızlı mikrobiyolojik yöntemler)
konuları işlenecektir.
BY-608 Ekonomik Önemi Olan Bakteriyofajlar
Bakteriyofaj çeşitleri, bakteriyofajlardan yararlanılan alanlar ve
ekonomik alanda bakteriyofajların neden olduğu sorunlar ve bunların
çözümüne dönük konular işlenecektir.
BY-610 Bakteriyofaj İzolasyonu ve Faj Vektörü Üretimi
Enterabacteriaceae üyesi bakterilerin çeşitli şekillerde plak verdiği
fajların fecal kirli sulardan izolasyonu ve olası faj-konak
karakterlerinin saptanması.
BY-612 Bilgisayarda Biyolojik Veri Değerlendirmesi
Bilimsel makalelerin bilgisayara
girilmesi ( WORD ) verilerin grafiksel ve tablo olarak sunumu (WORD –
EXCEL ) ve verilerin istatiksel değrelendirilmeleri ( SPSS )
BY-614
Deniz Kirliliği
Deniz kirlenmesinin tanımı,
deniz kirlenme türlerinin sınıflandırılması, kirletici kaynaklar
kirlenme türleri, Organik kirlenme (ötrifikasyon, mikrobiyal kirlenme),
Termal kirlenme, Radyoaktif kirlenme, Kimyasal kirlenme (Deterjan
kirlenmesi, Pestisit kirlenmesi, Petrol |