Anasayfa | Akademik | Eğitim | Bilimsel Etkinlikler

Anabilim Dalları | Duyurular | Linkler |Bölümümüz

 

 

BY-503 Statistical Methods in Biology

                The aim of the course is to consider various basic statistical techniques in conjunction with some experimental designs to those who are interested in Biological experimentation. Statistical tests which are frequently used  in biological research are dealt without the need of comprehensive mathematics. Among the subjects covered during the course are the normal, binomial and Poisson distributions, calculating probabilities, hypothesis testing, two group experimental design, transformations, student's t-test, chi-squared test, analysis of variation and parametric tests such as Wilcoxon test, sign test, rank correlation etc.

BY-505 Freshwater Pollution Ecology

                The ecology of certain freshwater invertebrates, their physiological and behavioral responses under the stress of pollution, the use of these organisms as pollutions indicator organisms are given in the light of current literature. The main pollutant groups dealt are heavy metals, chemical wastes, radio-active wastes and pesticides. Among the major animal groups covered are Protozoans, Decapoda, Mollusca and Insecta.

BY-509 Anaerob Biyolojik Atıksu Arıtma Teknikleri

                Organik bileşiklerin anaerob koşullarda fermantasyon yoluyla parçalanması ve çeşitli aşamalarda etkinlik gösteren mikroorganizma grupları. Biyoteknolojik önemi olan ara ve son ürünler, organik bileşiklerin eliminasyon yüzdeleri ve biyogaz verimi.

BY-513 Bitki Taksonomisi

                Taksonomi nedir. Taksonominin önemi ve değişik taksonomi tipleri. Linnaean taksonomisi ve öncesi, Devessieu ve doğal sistemler, filogeni üzerine oturtulmuş sistemler, Engler Bessey ve diğer sistemler. Bitki taksonomisi birimleri ve gelişimi, Nomenclatür'ün bitki taksonomosindeki rolü. Latince isimlendirmenin  önemi ve bitkilerin tanımlanmasında kullanılan kriterler.

BY- 515  Atıksu Biyolojisi

                Yüzey sularında ve kirlilik düzeyine bağlı olarak doğası değişmiş sularda indikatör mikroorganizmaların, zooplankton ve fitoplanktonların oluşturdukları tablolar ve atıksu arıtma tesislerinde biyokütleyi oluşturan organizma topluluklarının verim açısından değerlendirilmesi.

BY-517 Böcek Beslenme Fizyolojisi

                Metamorfoz, besin rezervleri ve simbiyotik mikroorganizmaların böceklerin besinsel gereksinimlerine etkileri; Beslenme prensipleri ve böceklerin kalitatif besinsel gereksinimleri; Besin maddelerinin kullanımı ve fonksiyonları.

 

BY-521                Fizikokimyasal Arıtma Tekniklerinin Biyolojik Arıtmada Uygulanmaları

                Aerob ve anaerob biyolojik arıtma tesisine gelen atıksuların arıtma verimlerinin arttırılması, nötralizasyon ve detoksifikasyonu ile biyolojik dengelerin korunması amacıyla fizikokimyasal yöntemlerle ön işleme sokulmaları ve uygulanabilecek yöntemlerin çıkış suları kalitesine etkisi.

BY-527 Böcek Sentetik Besinleri ve Hazırlama Teknikleri

                Meridik ve Holidik besin kavramları, besin bileşenlerini hazırlama teknikleri, Laboratuar koşullarını hazırlama yöntemleri ve deney materyalinin sterilizasyonu, böcekler için geliştirilmiş holidik ve meridik besinlerin karşılaştırmalı olarak analizi, sentetik besinler ile ilgili bazı genellemeler.

BY-529 Su Omurgasızları

                Tatlı su ve deniz ortamında yaşayan omurgasız hayvan guruplarından Protozoa, Porifera, Coelenterata, Ctenophora, Rotifera, Crustacea, Mollusca ve Echinodermata'ların anatomik ve morfolojik özellikleri ile sistematikteki yerleri incelenecektir.

BY-531 Bitkilerde Preparasyon Tekniği ve Uygulamaları

                Bitkisel örneklerin alınması, fikse etme ve materyalin saklanması. Boyama metotları, geçici ve daimi preparat yapımında değişik metotlar ile geçici ve daimi kapatma ortamları. Mikroskopta ölçme, kesit alma ve maserasyon yöntemleri hakkında bilgi verilecektir.

BY-533  Biosfer ve Noosfer I

                Biosfer ve özellikleri; enerji döngüleri; besin zincirleri; ekosistemde madde dolaşımı, primer prodüktivite, ekolojik piramitler; ekosistemlerin etkinliği, sekonder prodüktivite, biyosferdeki bozulmalar

BY-535 PAGE Elektroforez Teknikleri ve Uygulama Alanları

                Natif jel teknikleri ,gradient jel teknikleri, slab jel teknikleri, SDS slab ve gradient teknikleri, izoelektrik fokuslama yöntemleri, iki boyutlu akrilamid jel teknikleri, prensip ve uygulamaları.

BY-537 Bitki ve Bitki Toplulukları ile Ekoloji Faktörlerin İlişkileri

                Öncül bitkiler, süksesyon ve klimakslar sonucu oluşan bitki toplulukları, bitki topluluklarının strüktürü ve sınıflandırılması, primer sekonder vejetasyonlar, periyodik olan veya olmayan iklim, toprak ve biyotik faktörler, bu faktörler ile bitki türü, bitki populasyonu ve bitki birlikleri arasındaki ilişkiler, bu ilişkilerin ekosistem kavramı içerisinde değerlendirilmesi, elde edilen değerlerin uygulamada kullanılabilirliği, uygulamada ekolojik faktörlerin önemi ve ekolojik problemler.

BY-539 Çimlenme Ekolojisi

                Giriş (tanım ve çimlenmeyi kontrol eden faktörlerin genel değerlendirilmesi), Klimatik faktörler (sıcaklık ve önemi, sıcaklığın dormansi ile ilgisi, dormansinin kırılması). Hidrik faktörler (tuzlu ve tuzsuz topraklarda toprak suyu, yağışlar, nem ve dormansi), ışık ve etkileri. Toprak faktörleri (toprak strüktürü ve tekstürü, toprağın kimyasal bileşimi, toprak havası, CO2, pH ve bazı iyonların etkisi). Biotik faktörler (inhibitörler, kök salgıları, simbiyotik çimlenme, biotoptaki canlıların etkisi (mikroorganizmalar., bitkisel fauna, insan)

 

BY-543 Marine Fisheries

                The main topics covered during the course are; production cycles, migration and food webs in the sea, the age structure of fish populations, population dynamics, fish farming, regulation  of fisheries and biology of some economically important fish species.

BY-545  Çöller ve Çöllerde Yaşam

                Çöl kavramı, çöllerin genişlemesi, iklimi, morfolojik yapısı, çöl ikliminin biyolojik etkileri, bitki yaşamı ve özellikleri, çöllerin geleceği ile ilgili görüşler.

BY-547 Tatlı Su Ekolojisi

                Tatlı su ekolojisi: Tatlı su ortamın sınıflandırılması, tatlı su organizmalarının ekolojik sınıflandırılması, ekolojik faktörler ve organizmalara etkileri, pelajik bölgenin canlı toplulukları, bentik bölgenin canlı toplulukları

BY-549  Bitki Ekolojisinde Araştırma Yöntemleri

                Bitki ve toprak örnekleri alımı, analize hazırlanması ve fiziksel ve kimyasal analizleri.

BY-551 Böceklerde Üreme Fizyolojisi

                Böceklerde erkek ve dişi üreme sistemleri; oogenez ve ovipozisyon; çiftleşme ve döllenme, döllenme verimliliğini kontrol eden faktörler; hibernasyon ve diyapoz; üremede özel şekiller.

BY-553 Vitamin Metabolizması

                Vitaminlerin hormon ve enzimlerle ilişkileri; Vitamin noksanlığı ve fazlalığına bağlı semptomlar; vitaminlerin sınıflandırılmaları, metabolik işlevleri ve biyosentezleri.

BY-561 Heavy Metal Pollution in Aquatic Environment

                The course deals with the sources of metal accumulation in water bodies, effects of some physical and chemical environmental factors on metal toxicity and the effects of essential and nonessential metals on some physiological, biochemical and behavioral responses of aquatic organisms.

BY-563  Tek Hücre Protein Üretimi

                Tek hücre proteini üretiminde kullanılan mikroorganizmalar (bakteriler, mantarlar, mayalar ve algler), protein üretiminde kullanılan substratlar, değerlendirilemeyen çeşitli atık maddeler, üretim teknolojileri, mutasyonlar ve genetik madde transfer yöntemleri kullanılarak mutant suş üretimi, tek hücre proteininin özellikleri, insan ve hayvan sağlığı açısından önemi ve kullanım alanları.

BY-565  Deniz Zooplanktonları

                Deniz ortamındaki zooplanktonların sınıflandırılması, deniz zooplanktonlarının biyolojik ve ekolojik özelliklerinin incelenmesi ve Akdenizde bulunan zooplankton türleri ele alınacaktır

BY-573 Metals and Their Compounds in the Environment

                In this course various aspects of metals in the environment such as occurrence, analysis and biological relevance will be given in details. The topics of subjects which will be studied are the physical and chemical properties, analytical methods, sources, production, important compounds, uses, waste products, recycling, distribution of metals in the environment and in food and in living organisms. The course will include uptake, absorption, transport, distribution, metabolism and elimination of metals in animals and humans. Bioindicators for monitoring metals in the environment are also the concern of this course, as well as metallothioneins which are low molecular weight metal-binding proteins induced in relation to metal exposures.

BY-577 Genetik Madde Transferinde Kullanılan Vektörler

                Bu alanda kullanılan vektörlerin özellikleri, büyüklükleri, vektör tipleri ve vektör üretimi konuları işlenecektir.

BY-583 Molecular, Biochemical and Cellular Perspectives of Aquatic Toxicology

In this course, toxic effects of xenobiotics such as heavy metals and pesticides in the aquatic environment will be studied considering their molecular, biochemical and cellular perspectives in aquatic animals, particularly in fish. The subjects covered in this course will be as follows;  enzymology and molecular biology of xenobiotic-conjugating enzymes, biochemistry and molecular biology of monooxygenases, modulation of blood cell-mediated oxyradikal production, cellular responses in chronic toxicity, expression of oncogenes and tumor suppressor genes, pathobiology of chemical-associated neoplasia, DNA adduct analysis and mechanisms of metal regulation. Use of physiologically based toxicokinetic models in a mechanistic approach to aquatic toxicology is also one of the subject which will be investigated in this course.

BY-587  Bitki Hormonları ve Diğer Büyüme Regülatörleri

                Hormon nedir; gen aktivitesinde hormonların rolü. Oksinler; sentez ve yıkımı, taşınımı, oksinlerin ekstraksiyonu ve ölçümü; Oksinler ve herbisitler. Gibberellinler ve metabolizması, çimlenme dormansi ve büyümeye etkisi. Sitokininler, metabolizması, sitokinin sentezi ve taşınması, organ yapıcı ve hücre bölünmesine etkisi; Gövde ve kökte sitokininlerin etkisi; klorofil sentezi ve kloroplast gelişmesine sitokininlerin etkisi; İnhibitörler. Absisik asit ve etilen sentez ve bitkilerdeki etki mekanizması. Salisilik asit ve turgorluluk, poliaminler ve diğer büyüme engelleyiciler.

BY-591  DNA Elektroforezi ve Agaroz Jel Tekniği

                Elektroforez teknolojisinin gelişme aşamaları ve agaroz yardımıyla protein ve DNA'nın bileşenlerine ayrılması. Agaroz jellerin yapısı, elektroforez karakteristikleri, analitik ve preparatif elektroforez uygulamaları ve immun elektroforezde agar tekniğinin rolü.

BY-593                Mikrobiyoloji Laboratuvar Teknikleri

                Sterilizasyon yöntemleri, aerob, anaerob ve fakültatif anaerob kültür teknikleri, saf kültür izolasyon yöntemleri, antibiyotik hassasiyet testleri, gıda (su, içecek ve yiyecekler) maddelerinden, göllerden, denizlerden ve nehir sularından mikroorganizma izolasyon ve identifikasyon yöntemleri.

BY-597  Çevre Kirlenmesinin Bitkiler Üzerindeki Etkileri

                Çevre kirlenmesi; tanımı, sınıflandırılması. Termal kirlenme, kimyasal kirlenme, endüstriyel kirlenme ve radyoaktif kirlenmenin bitkiler üzerindeki etkileri. Doğal alanların yanlış kullanımı; Tarımsal arazi kazanma, yasa dışı kesim ve söküm, monotipik ve ekzotik plantasyonlar, otlatma, yerleşime açma ve turizmin bitki ve bitki örtüleri üzerine etkileri.

BY-599                Parazitoidlerde Parazit-Konak İlişkileri

                Parazitin konak seçimi, değişik konaklardaki gelişme süresi, cinsiyetler ve çıkış oranı, yumurta bırakma davranışı, konak şeklinin ve yapısının etkileri, kokonun etkisi, konak büyüklüğünün etkisi, parazitleme gücü, yumurtlama süresi, yumurtaların açılma oranı, parazit ömrü.

BY-605  Pestisit Biyokimyası

                Pestisitlerin sınıflandırılmaları; Pestisitlerin absorbsiyonları, metabolize edilmeleri, atılımları ve metabolitleri; Biyoakümülasyon; Biyokonsantrasyon faktör, lipitde çözünürlük, suda çözünürlük; Partisyon katsayısı, suda çözünürlük ve biyokonsantrasyon faktör arasındaki ilişkiler, akut toksisite, biyokimyasal özellikler ve biyokonsantrasyon faktör arasındaki ilişkiler, lipofilik bileşikler, biotransformasyon.

BY-609  Faj Ekolojisi

                Bakteri virüslerinin temel özellikleri ve tarihçeleri, bakteriyofajların taksonomileri, dağılımları, tatlı sulardaki fajların ekolojisi, deniz sularındaki fajlarının ekolojisi, atık su arıtma tesisleri ve sulardaki bakteriofajların sonları, fekal kirliliğin göstergesi olarak, Cyanofajlar, faj ekolojisindeki metotlar ve besinlerdeki bakteriofajlar anlatılacaktır

BY-611  DNA Klonlama ve Gen Kütüphaneleri Hazırlanması

                Moleküler klonlamada yaygın olarak kullanılan önemli ligaz, polymeraz, transferaz, transkriptaz, endonükleaz ve exonükleaz gibi enzimlerin davranışları ve restrüksiyon endonükleazlarında tanıma sequensleri bulunan Class II endonükleazlarının başlıcalarının tanıma sequensleri, RFI ve RFII tipte süpercoil DNA moleküllerinin vektör olarak kullanılabilirliği ve genlerin amplifikasyonu.

BY-617 Gen Biyoteknolojisi 

PCR  (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) teknolojisi kullanılarak genler veya spesifik cDNA’ların izolasyonu, hibridizasyon teknikleri yardımı ile nükleik asitlerin karakterizasyonu (kromozomal DNA, plazmid, faj, retroviral RNA ve mRNA),  RNA düzeyinde gen ekspresyonunun analizi, protein düzeyinde gen  ekspresyonunun analizi, rekombinant proteinlerin üretilmesi ve saflaştırılması, gen indüklenmesine bağlı olarak yeni proteinlerin identifikasyonu ve üretimi ve gen klonlanmasını içeren aşamalar anlatılacaktır.

BY-619 Böceklerde Sindirim  Metabolizması

Böceklerin besinsel ihtiyaçları olan proteinler, karbonhidratlar, lipidler, vitaminler, mineraller ve diğer besin bileşenlerinin enzimatik yolla tüm sindirim sistemde nasıl metabolize oldukları, kullanılabilir ve kullanılamaz tipteki besin bileşenleri ile ilgili konular.

BY-621 Türkiye’nin Sulak Alan Bitkileri Ve Vejetasyonu

Sulak alanın tanımı ve ekosistem icerisindeki önemi, Türkiye’de yayılış gösteren bazı önemli sulak alan bitkileri ve vejetasyonu. Bunların akuatik ortam şartlarına anatomik ve morfolojik adaptasyonları. Sulak alan bitki örtüsünün, ortamdaki suyun derinlik, tatlı, acı ve tuzluluk gibi özelliklerine bağlı olarak sınıflandırılması.

BY-631 Gıda Katkı Maddelerinin Genotoksik Etkileri

Gıdalarda kullanılan antimikrobiyal maddeler, tatlandırıcılar, renk maddeleri, asit düzenleyiciler ile bunların mutajenik, kanserojenik ve sitotoksik etkileri.

BY-633 Su Toksikolojisi               

Sudaki çeşitli kirleticilerden metaller, pestisitler ve hidrokarbonlu bileşiklerin özellikleri, bunların su canlıları tarafından alınmaları,birikimleri ve atılımları, su organizmalarındaki letal ve subletal etkileri, su organizmalarının dokularındaki birikimi ile canlılardaki davranış mekanizmalarına etkileri incelenecektir.

BY-635 Fire Ecology In Mediterranean Ecosystems 

Introduction to adaptations of Mediterranean plants to fire. Seed production and post-fire germination. Community patterns following fire. Early post-fire herbaceous cover. Post-fire development of the shrub cover. Post fire succession in different habitats.

BY-637 Conservation Of Natural Resources            

The demand for natural resources, the impact of climate change, biodiversity and species extinction, the value of biodiversity. The meaning and role of the World Heritage sites, Biosphere reserves, Botanical gardens, specially protected areas, national parks, etc.

Discussion and explain on some  important international environmental agreements for protection of species and habitats, marine and atmospheric pollution.

BY-639 Etnobotanik                       

Etnobotanik tanımı, insanlar ve bitkiler arasındaki ilişkiler, geçmişte ve günümüzde bitkilerin kullanım durumları, besin ve endüstri bitkileri, tıbbi bitkilerden örnekler, botaniksel, ekolojik ve coğrafik özellikleri, sistematiklerinin yapılması.

BY-641 Endüstriyel  Enzimler Ve Kullanım Alanları               

Amilaz, Selülaz, Proteaz, Xylanase, Lipaz, Kitinaz, Beta Laktamaz, Glikoamilaz gibi mikrobiyal kökenli enzimlerin, üretimi, aktivitelerinin saptanması ve kullanım alanları anlatılacaktır.

BY-643 Mikrobiyal Enzim Biyoteknolojisi

Bu derste, mikrobiyal enzimler, enzim üretiminde kullanılan teknikler, substratlar ve suşlar anlatılacaktır. Rekombinant suş üretimi (Genetik transfer ve mutasyon teknikleri kullanılarak), enzimlerin saflaştırılması ve uygulama alanları anlatılacaktır.

BY-645 Mikrobiyal Enzim Analiz Yöntemleri          

Bu derste, Endüstriyel alanda kullanılan mikrobiyal enzimler anlatılacaktır. Enzim çeşitleri, substrat spesifiteleri, pH optimumları ve pH stabiliteleri, Sipesifik aktiviteleri, Termal stabiliteleri, Enzim kinetiği, Relatif aktivitelerinin saptanmasıyla ilgili konular anlatılacaktır.

BY-649 Transgenik Organizma Üretimi Ve Teknolojisi         

Bu derste, Biyoteknolıji için önemli mikroorganizmaların sınıflandırılmaları ve üretimleri, Rekombinant DNA teknolojisi yöntemi ile istenilen hedeflere dönük organizma üretimi, Maya, Bakteri ve diğer organizmaların transgenik duruma getirilmesi ve bunların ürünleri ile yararlanılma alanları, Gıda endüstrisi atıklarının değerlendirilmesinde transgenik organizmaların kullanımı ve Genetik değişikliğe uğratılmış mikroorganizmalar ve ürünleri hakkında bilgiler verilecektir.

BY-651 İleri Hücre Biyolojisi I                             

Yaşamın molekülleri, DNA, RNA, proteinler, bağışıklık sisteminin moleküler temeli. 

BY-653 Hayvansal Dokularda Mikropreparasyon Yöntemleri    

Hayvansal dokularda preparat yapma yöntemleri, total preparasyon yöntemi, kuru kapatma, froti yöntemi, fiksasyon, çok kullanılan fiksatif karışımlar, dehidrasyon, saydamlaştırma ve parafine gömme, parafin kesitlerin hazırlanması, kesitlerin boyanması, boyanmış preparatların kapatılması

BY-655 Böcek Fizyolojisi                           

İntegüment; Solunum, Dolaşım, Sindirim, Boşaltım sistemleri; Gelişme, Üreme, Beslenme ve Metabolizma Fizyolojileri

BY-657 The Aquatic Environments  as Living Spaces

                Through this course the freshwater environment will be dealt on their physical and chemical properties, ecology of the standing and flowing waters and animal communities live in. The marine environment will also be dealt on their physical and chemical properties, oceanic circulation and water movement, plankton communities, oceanic nekton, the pelagic environment, the benthic environment, intertidal ecology, estuaries and human impact on the sea. This course will also include various kinds of pollution problems in the aquatic environment which affects ecological needs of aquatic animals.

BY-659 Ecophysiology

Effects of the ecological factors on animal physioloy are the subjects of this course. The main topics of this study will be the respiration, food and energy metabolism, temperature effects and regulation, water and osmotic regulation, excretion and hormonal  control in different animal  groups.

BY-661 Fungal Biyoteknoloji

                Yüksek Mantarlarda meyva ve enzim sentezine yönelik uygulamaların tanımı ve ortam, nem, ısı ve oksijen-karbondioksit gereksinimlerinin incelenmesi ile, kitlesel üretime yönelik teknolojik araştırmaların detaylı incelenmesi.

BY-663 Vejetasyon Dinamiği

                Vejetasyonun oluşumuna ve değişimine etki eden biyotik ve abiyotik faktörler, ekosistemlerin genel yapısı ve işlevleri, süksesyon ve süksesyon çeşitleri, klimaks  vejetasyonlar ve klimaks çeşitleri, monoklimaks ve poliklimaksa dair çeşitli görüşler, primer ve sekonder vejetasyonlar. Tüm bu konularla ilgili olarak arazi çalışmaları yapılacaktır.

BY-665 Doğadaki Patojen Enterobacteriaceae Üyeleri I

                Enterobacteriaceae Familyasının özellikleri ve kompozisyonu, Hayvan ve insan sağlığı ve hastalıklarıyla ilişkileri, Besin kaynaklı Enterobakteriyel  patojenler ve romatoid hastalıkları, Toksinleri, Bakteriyel invazyonun basamakları, antibiyotikler ve diğer kemoterapotiklere direnç mekanizmaları.

BY-   Moleküler Genetik I

Nükleik asitler, DNA (DNA molekülünün yapısı, DNA formları, DNA’nın denatürasyonu ve renatürasyonu), genetik materyal çeşitleri, DNA’nın replikasyonu, replikasyon tipleri, RNA (RNA’nın yapısı ve RNA çeşitleri), genin ekspresyonu, transkripsiyon, primer RNA’ların (pre-RNA) modifikasyonu, genetik sözlük ve genetik kodun açıklanması, protein sentezi (translasyon), protein (protein molekülü ve yapısı), mutasyonlar, mutasyon çeşitleri, gen mutasyonunun sebepleri, mutasyonların moleküler mekanizması, suni mutasyonlar, DNA zararlarının onarılması (DNA’nın tamiri), mutasyonların suppresyonu (baskı altında tutulması), genomdaki genlerin düzeni ve genomdaki değişmeler (rekombinasyon), Eukaryotlarda rekombinasyon, virüslerde rekombinasyon, bakterilerde rekombinasyon.

BY-.. Fitolojik Çeşitlilik

                Floranın araştırılıp ortaya konulması, floristik bölge endemizm durumlarının saptanması, floradaki tehlike sınıfları, bu sınıfların tanımı ve sınıfların saptanma yöntemi.

BY-..... Akdeniz Ekosistemleri

                Ekosistemin tanımı, ekosistemlerin ayrımını tayin eden faktörler, yeryüzünde ve ülkemizde Akdeniz'in yeri, Akdeniz'in genel ekolojik özellikleri ve başlıca ekosistemler bu sistemlerin varlığını, dağılımını olumlu ve olumsuz yönde etkileyen faktörler.

BY..... Holobasidiomycetes’de Genetik Rekombinasyon Teknikleri

                Ağırlıklı olarak kültüre alınmış Holobasidiomycetes grubu mantarlarda verim ve ortam gereksinimleri açısından ekonomik artışlar ve kolaylıklar sağlanacak genetik manipülasyonların uygulama şekilleri ve yeni rekombinantların verim açısından incelenmesi.

BY.... Bitkiklerde Oksidatif Stres
                                                                             

                Oksijen aktivasyonu,Radikal oksijenin biyolojik reaksiyonları, Lipidlerin oksidatif tahribatı, Tipik peroksidasyon reaksiyonları, Bitki hücresi memranında özel reaksiyonlar, Proteinlerin oksidatif yıkımı, DNA’nın oksidatif yıkımı, Aktive edilmiş oksijen ürünleri bulunduğu yerler; Kloroplast, Mitokondri, Endoplazmik retikulum, Küçük moleküller, Plazma zarı, Hücre çeperi, Savunma mekanizması; Süperoksit dizmutaz, Katalaz, Askorbik asit, Glutatyon, Takoferol, Koratinoid, Herbisit dirençliliği, Herbisitlerin ışığa karşı hassasiyeti.

 
BY....  Kurak ve Yarı Kurak Ekonomik Bitkilerin Ekofizyolojisi      

 

                Dünyanın kurak ve yarıkurak alanlarının ekonomik bitkileri, dünyanın kurak ve yarı kurak  bölgeleri, Ekofizyolojisi, Bitki stresi ve Azot fiksasyonu, Su sitresi, Sıcaklık stresi, Tuz stresi, Fotosentez; Karbon reaksiyonları, C3,C4, CAM tipi fotosentez. Bitki metabolitleri, Anatomik ve morfolojik adaptasyonlar seçilmiş kurak bölge bitkilerinin ekofizyolojisi ve kullanılmaları.

BY-.... Salmonella/Mikrozom Test Sistemi                                 

                Salmonella typhimurium test suşlarının genotipleri, suşların genotip kontrol testlerinin yapılması, kültür ve master plaklarının hazırlanması, memeli karaciğerinden mikrozom fraksiyonunun elde edilmesi, suşların stoklanması, Ames mutajenite testinin yapılışı.

BY...Principles and Techniques of Practical Biochemistry 

General principles of biochemical  investigations; centrifugation techniques; Chromatographic techniques; electrophoretic techniques; spectroscopic techniques; radioisotope techniques; potentiometric, electrometric polarographic and manometric techniques; recent advances in methodologies. Modern instrumental techniques will be employed whenever appropriate.

 BY..The ATP Cycle and Cell Bioenergetics

The first and second laws of thermodynamics; the concepts of entropy and free energy; the chemistry of ATP; energy yielding and energy requiring cell activities; phosphate transfer reactions; mechanisms of electron transport and oxidative phosphorylation; regulation of ATP production and other energy rich nucleosides. Effects of toxicants on electron transport and oxidative phosphorylation

BY....Metabolic Regulations

Principles of metabolic regulation in mammalian systems. Metabolic control enzymes and pathway fluxes in cells, tissues and the whole organism with emphasis on how metabolic control of pathways changes in response to nutritional status.

BY....Global Environmental Change

Physical, chemical, biological and ecological dimentions of global environmental change; the role of human activities in shaping and changing the environment along with the discussions on the recent datas of the subject.

BY...Bitki Hücre Yapısı ve Metabolizması                                                  

Bitki Hücresinin Yapı ve Fonksiyonu, Bitki Hücresini Çalışma Yöntemleri, Hücre metabolizmasının Düzenlenmesi, Hücre Organellerinin Yapı ve İşlevleri, Nukleus, Plastitler, Mitokondri, Ribozomlar, Golgi Kompleksi, Endoplazmik Retikulum vb. organellerde yapı, işlev ve biyokimyasal aktiviteler

BY...Akuatik ve Yarı Akuatik Ortamlarda Bitki Yaşamı                 

Akuatik Bitkiler, Akuatik Çevre, Su Altında Fotosentez, Akuatik Bitkilerde Büyüme, Gelişme ve Deyişim, Besin Elementleri, Sıcaklık, Tuzluluk ve Su Hareketlerinin Bitki Yaşamına Etkileri, Akuatik Bitkilerde Biyotik Etkileşimler, Yarı Akuatik Bitkiler ve Suya Dayanıklılık, Tohum ve Fidelerde Oksijen Stresi, Oksijen Stresi Altında Kök Fizyolojisi, Tüm Bitkinin Oksijen Stresine Cevabı

BY...Ekolojik İndikatör Olarak Algler                                                  

Tatlı su Elkosisteminde İndikatör Algler, Deniz Ekosisteminde İndikatör Algler, Çevre Kirleticilerin Alglere Etkileri, Su Kalitesinin Belirlenmesinde Algler, Temiz Su Algleri, Kirli Su Algleri, Ağır Metal Düzenleyicisi Olarak Algler, Algler ve Ötrifikasyon

BY...Biochemical Toxicology: Definition and Scope                    

Introduction, Toxicology, Biochemical Toxicology; General Description, Portals of Entry, Distribution, Metabolism, Sites of  Action, Excretion, Overview of Molecular and Techniques.

BY..Conjugation and Elimination of Toxicants                        

Conjugation reactions, Glycosides; Glucuronides, Sulfation, Methylation; N- Methylation, O- Methylation, S- Methylation, Acylation; Acetylation, Amino Acid Conjugation, Glutathione S-transferases; Allosteric Regulation, Induction by Xenobiotics, Cystein S-Conjugate β-Lyase, Lipophilic Conjugation, Phase II Activation, Phase III Elimination; MRP/MOAT, p-Glycoprotein

BY...Principles of Environmental Toxicology                                          

Effects of Pollutants on Ecosystems; An Introduction to Food Webs, Some Speccific Examples of the Environmental Toxicities, Risk versus Benefit, Development of Safer Chemicals, Environmental Toxicity Testing, Environmental Monitoring

BY...Ekotoksikoloji 

Cevredeki toksik maddelerin organizmalara ekolojik etkileri, toksik maddelerin canlilardaki biyokimyasal, immunoljik ve fizyolojik etkileri, doğal toksinler ve çevre kirliliğin belirlenmesinde biyolojik göstergelerin kullanımı incelenecektir.

 

YLBY-201 / DBY-203 Uzmanlık Alan Dersi

                Biyoloji Anabilim Dalında Enstitümüz tarafından Doktora tez programı kabul edilen Doktora öğrencileri için danışman yönetiminde son gelişmelerin ışığı altında araştırma ve inceleme sonuçlarının değerlendirilmesi tartışılması. (tüm doktora öğrencisi bu programa diğer Lisansüstü derslerde olduğu gibi yarıyıl başlarında kayıt yaptırmak zorundadır.)

BY-500 Mikrobial Ekoloji

                Ekosistemlerin başlıca mikroorganizma grupları, ekosistemdeki enerji transferinde mikroorganizmaların rolü, elementlerin dönüşümlerinde mikroorganizmaların etkileri, (biyolojik devirler: karbon, azot, kükürt, fosfor, ve diğer elementlerin devirleri). karasal ekosistemlerde mikroorganizmalarla diğer gruplar arasındaki etkileşimler (spermosfer, rizosfer, fillosfer, ölü örtü ve etkileri).

BY-504 İleri Hücre Fizyolojisi

                Hücre bileşenleri ve görevleri; Hücrenin içinde bulunduğu çevre ile ilişkisi, Hücre zarından madde iletimi; Osmoz filtrasyon ve difüzyon, pasif iletim mekanizmaları, aktif iyon iletimi; Biyoelektrik potansiyeli, zar potansiyelleri ve bunların oluşmasında pasif ve aktif mekanizmaların rolü. Hücrenin aksiyon potansiyelleri ve buna ilişkin olaylar; Hücrede cereyan eden anabolik ve metabolik reaksiyonlar.

BY-506 Bitki Toplama, Kurutma ve Herbarium Tekniği

                Bitki örneklerinin toplanmasında göz önüne alınacak hususlar, örneklerin toplanma şekli, örnekleri etiketleme ve presleme sistemleri. Bitki familyası, cins, tür, alt tür ,varyete ve form adlarının Latince yazım kuralları. Bitki taksonomisi birimlerinde yer alan taksonomik adlarının ifade ettiği anlamlar, bitki sinonimlerinde (Syn), endemiklerde ve tip (Type) örneklerinde uygulanacak yöntemler.

BY-508 Marine Ecology

                Environmental aspects of the sea, water circulation, and water movements, physical and chemical aspects of the marine environment, tides and the intertidal environment, the sea bottom, estuarine environment and organic production in the sea are given through this course.

BY-510                Biyolojik Arıtmada Sistem Kombinasyonları

                Aşırı organik yüklü atıksularda en verimli arıtma teknolojilerinin bölgesel iklim özellikleri de dikkate alınarak en ekonomik ilk yatırım ve işletme giderleriyle arıtılabilirlikleri konusunda uygulanabilecek sistem kombinasyonlarının seçimi ve mantığı.

BY-514                Biyolojik Arıtma Tesislerinde Çamur Problemi ve Değerlendirme

             Teknolojileri

                Özellikle aerob biyolojik arıtma tesislerinde biyokütlenin işletme verimi ve gereksinim fazlası aktif çamur kitlesinin kabul edilebilir boyutlarda tutulabilmesiyle ilgili problemler, bunların modern teknolojik çözüm yolları ve oluşan aktif çamur fazlasının ekonomik olarak yok edilmesi veya doğaya geri döndürülmesi ile ilgili geliştirilmiş modern uygulamalar.

BY-516  Doğaya Uyumlu Biyolojik Arıtma Teknolojileri

                Özellikle kırsal alanda yüksek bitkiler aracılığı ile düşük yatırım maliyetli decentral arıtma tesislerinin kurulması ve uygulanacak parametrelerin değerlendirilmesi.

BY-520 Polinoloji (Polenbilimi)

                Polenin tanımı, yapısı, yüzey şekilleri ve özellikleri, Gymenosperm ve Angiospermlere ait polen örneklerinin tanıtımı, polen preparatı hazırlanışı, polen diyagramları ve yorumları, polinolojinin uygulama alanları.

BY-522  Biyosfer ve Noosfer II

                Noosfer nedir, besin kaynaklarının azalması ve biosfer potansiyeli arasındaki ilişkiler, nüfus patlaması ve göçlerin etkileri ve bununla ilgili çevre düzenlemeleri; insanı nasıl bir çevre bekliyor, insan türü ve geleceği hakkında somut veriler yardımıyla bilgiler aktarılacaktır.

BY-526  Toprak Biyolojisinde Araştırma Yöntemleri

                Toprakta, potansiyel ve zenginleştirilmiş ortamlarda mikrocanlı faaliyetleri (karbon ve azot mineralizasyonları) incelenecektir.

 

BY-528  Böcek Biyokimyası

                Böceklerde homeostasis ve metabolizmanın ayırt edici özellikleri, gelişmenin hormonal kontrolü, böcekler ve dış çevreleri; feromonlar ve savunma maddeleri.

BY-530 Deniz Bentozu

                Bentik organizmaların toplanma metotları ile deniz ortamında bentik organizmaların bölgesel ve mevsimsel değişimleri ve biyoekolojik özellikleri incelenecektir. Ayrıca bentik organizmaların sınıflandırılması, yaşam şekilleri, besin durumları, üremeleri ve gelişimleri tartışılacaktır.

BY-534 Prokaryot ve Eukaryot Organizmalarda DNA İzolasyon Yöntemleri

                Procaryot ve eucaryot organizmaların seleksiyonu, DNA izolasyonunda kullanılan yöntemler ve uygulaması, izole edilen plasmidler ve DNA'nın agaroz elektroforez tekniği ile separasyonu ve karşılaştırılması. Maya, mantar ve farelerden DNA izolasyonları ve bunların Pulsed field tekniği kullanarak separe edilmeleri.

BY-540 Environmental Pollution

                Water and air pollution; Solid wastes and radioactive pollutants; noise pollution; Control of pests and weeds.

 

BY-544 Viroloji Teknikleri ve Doku Kültürü

                Virüs laboratuvarında yapı ve kullanım özellikleri; hayvan deneyleri ve yumurta tekniği; doku kültürü ve kültür ortamı çeşitleri, nötralizasyon; kompelement bağlanması; hemaglutinasyon ve hemaglutinasyon inhibisyonu teknikleri.

BY-546                Rekombinant DNA Metotları

                Ethidium bromide-cesium chloride yöntemiyle plasmid DNA larının izolasyonu, ethidium bromide-cesium chloride solusyonundan DNA ların saflaştırılması, DNA dan ethidium bromid’ın uzaklaştırılması, DNA nın elektroforezinde seperasyonu, boyanması, RNA teknikleri, slab gellerde DNA nın geri kazanılması, Saccaromycetes cereviciae, Pseudomonas aeruginosa’da transformasyon ve gen klonlanması, in vitro mutasyon teknikleri

BY-550 Marine Plankton

                Methods of plankton collection, sorting and quantitative estimation of planktonic organisms, regional and seasonal characteristics of plankton in marine environment are discussed.

BY-552 Sitogenetik

                Bitkilerin karyotipi, mitoz bölünmeyi incelemek ve mitozdaki sitogenetik anormallikleri saptamak amacıyla kök ucundan daimi preparatların hazırlanması, polen ana hücresinde meios bölünmeyi incelemek ve meiosdeki sitogenetik anormallikleri saptamak amacıyla anterlerden ezme metodu ile daimi preparatların hazırlanması, insanda kromozom aberasyonunu incelemek amacıyla insan kanından daimi preparatların hazırlanması, kardeş kromatid değişimini (KKD=SCE) incelemek amacı ile insan kanından preparat hazırlanması, insan kromozomlarında çeşitli bantlama metotları, X ve Y kromatinini incelemek amacıyla preparat hazırlanması.

BY-554 Böceklerde Karbohidrat Biyokimyası

                Böcek hemolenfinin ve dokularının karbohidrat içeriği, hemolenf şekerinin barsak absropsiyonu ve fizyolojisi, böceklerde karbohidratların kullanımı ve biyosentezi, karbohidrat metabolizması üzerine hormonal etkiler, glikoproteinler ve kitin.

BY-560 Stomaların Yapı ve Mekanizmaları ve Fotosentez-Transpirasyon İlişkileri

                Stoma anatomisi ve stoma hareketlerinin fizyolojik görünüşü, karbondioksit konsantrasyonunun stomatal açılmadaki etkisi, uyarılmanın iletilmesi, ışığa ve diğer faktörlere stomanın tepkisinde yer alan hipotezler ve mekanizmalar. Koruyucu hücrelerde fotosentetik üretim. Nişasta-şeker hipotezi, geçirgenlik hipotezi, karbondioksitin etki mekanizması-karanlık fiksasyonu. Transpirasyonun rolü ve ölçümü, ekosistemdeki bitkilerin enerji değişimleri.

BY-562 Planktonoloji

                Planktonoloji: Planktonik türlerde beslenme, üreme, gelişme ve fizyolojileri ile plankton populasyonlarının bölgesel dağılımları, dinamiği, geçici değişimleri, birbiriyle ve ortamla ilişkileri, planktonun besin zincirindeki yeri ve enerji transferindeki rolü, fizikokimyasal değişikliklere uyumları, küme oluşturmaları ile pollusyona ve pollutantlara karşı tepkileri incelenecektir.

BY-564 Prokaryot ve Eukaryot Organizmalar Arasında Gen Transfer Yöntemleri

                Organizmaların izolasyonu, genetik özelliklerinin saptanması için gerekli testlerin yapılması, izole edilen DNA yapılarının konjugasyon, transformasyon, füzyon ve elektrofüzyon yöntemleri kullanılarak transferi.

BY-566 Moleküler Genetik II

Bakteri hücrelerindeki plazmidler, bakterilerin atlamalı genleri ve transpozisyon, Eukaryotlarda hareketli genetik elementler, retrovirüsler ve onkogenler, Prokaryotlarda gen regülasyonu, virüslerde gen regülasyonu ve konak hücrelerde virüslerin oluşması, Eukaryotlardaki genlerin yapısı, ekspresyonu ve regülasyonu, moleküler genetik ve tıp, Thalassaemie’ler, kollajen genlerinin yapısı, immun sistemin moleküler genetiği, Eukaryotlarda ekstra kromozomal DNA’lar (mitokondri genomu ve kloroplast genomu), bakteri, mitokondri, kloroplast arasındaki genetik benzerlikler ve filogenetik ilişkiler, gen mühendisliği, DNA baz sıralarının saptanması.

BY-572 Water Pollution and Fish Physiology

                Physiological responses of fishes to various pollutants such as metals, pesticides, detergents, polychlorinated biphenyls and petroleum hydrocarbons in the aquatic environment will be given in this course. The course will cover following metabolic effects of water pollutants; respiratory and cardiovascular responses, hematology, osmotic and ionic regulation, physiological energetics and, reproduction and growth. Environmental hypoxia and uptake, accumulation, biotransformation and excretion of xenobiotics are also the subjects which will be studied here.

BY-574 Toxic Effects of Metals and Pesticides on Animals

                This course deals with the toxic effects of metals and pesticides in the environment on animals including humans. The subjects covered throughout this course will be the principles of toxicology and absorption, distribution, excretion and biotransformation of metals and pesticides in the metabolism. The course include the toxic effects these pollutants on the blood, tissues and organs of animals. Factors influencing toxicity of metals and pesticides are also the subjects which will be given here.

BY-576 Sucul Ekosistemlerde Ağır Metallerin Etkileri

                Tatlı su ve deniz ortamına giren ağır metallerin kaynakları, bu metallerin diğer faktörlerle olan etkileşimleri, sucul ekosistemlerde yaşayan omurgasız ve omurgalı hayvanlarda özellikle balıklarda ağır metallerin; alınımları, biyotransformasyonu, akümülasyonu ve toksik etkileri ile bazı biyokimyasal parametreler üzerindeki etkileri incelenecektir.

BY-580 Bitkilerde Stres Tipleri ve Direnç Mekanizmaları

                Stres terminolojisi; stresin bitkilere zararı; stres direnci; su ve kuraklık stresi; su stresi adaptasyonları ve korunma mekanizmaları; radyasyon stresi tipleri ve zararları;, tuz stresleri ve diğer stresler. stres tepkilerinin karşılaştırılması. genel stres tepkisi kavramı. direnç ve zarar tepkilerinin karşılaştırılması.

BY-582 Türkiye’nin Flora ve Vejetasyon Yapısı

                Flora tarihçesi, flora ve vejetasyon oluşumunun ekolojik şartları, Türkiye bitki örtüsünün geçirdiği evrim ve flora alanlarında değişmeler, Türkiye Florası’nın kökeni ve paleoflorası, 10 ciltlik Türkiye Florası’nın önemli özellikleri, yurdumuzun flora bölgeleri, endemizm ve endemik bitkileri, vejetasyon formasyonları.

BY-584 Vejetasyon ve Anız Yangınlarının Ekolojik Etkileri

                Vejetasyon ve anız yangınlarının karakteristik özellikleri, tarihçesi ve çıkış nedenleri, denetimli yakma tekniği. Yangının toprak nemi, tekstürü, mikrokliması, verimliliği ve kimyasal kompozisyonu (asitlik, organik madde, azot, kalsiyum, fosfor, potasyum, minor elementler) üzerine etkisi. Yangının canlı organizmalar (ilkel bitkiler, bitki zararlıları, bakteriler, omurgasızlar, omurgalılar, bitki ve bitki toplulukları) üzerine etkisi.

BY-586                Böceklerde Protein Metabolizması

                Böcek beslenmesinde önemli yer tutan temel ve temel olmayan amino asitlerin sentezledikleri ve birbirlerine dönüşümleri, reaminasyon ve transaminazların metabolik rolleri, keto asitlerin metabolizmasında yer alan glukogenik ve ketogenik yolların metabolizması, aminasyon ve deaminasyon olaylarının beraberinde yer aldığı protein metabolizması ile ilgili spesifik konular.

BY-588 Bakteri Genetiği

                Bakterilerin genetik yapılar, bakterilerde bulunan ekstrakromozomal elemanlar ve bakteriyofajların genetik yapılar, bakteriler arasındaki rekombinasyon olayları işlenecektir.

BY-592 Moleküler Biyoteknoloji

                Moleküler biyoteknolojideki yenilikler, rekombinant DNA teknolojisi, moleküler araştırma prosedürleri, Prokaryotlarda gen ekspirasyonunun manipulasyonu, Eukaryotlarda heterolog proteinlerin üretimi, direk mutagenecis ve protein mühendisliği konuları hakkında bilgi verilecektir

BY-594                Doğadaki Patojen Organizmalar

                Canlılarda enfeksiyon oluşturan çeşitli bakteriyel etmenlerin morfolojileri, fizyolojileri, virulensi, epidemiyolojisi, izolasyon ve identifikasyonu.

BY-596  Çevre Mikrobiyolojisi ve Ekolojisi

                Toprak, su ve atmosferdeki mikroorganizmaların dağılımları ve ekolojisi anlatılacaktır.

 

BY-598  Böcek Sindirim Fizyolojisi

                Böceklerde sindirim kanalının anatomik organizasyonu, fonksiyonel bölgeleri; Besin maddelerinin sindirim kanalında ilerlemesi; Enzim aktivitesi ve besinin absorpsiyonu için gerekli şartlar ve bunları sağlama mekanizması.

BY-606  Gıda Mikrobiyolojisi

                Mikroorganizma gıda ilişkileri, gıdalarda indikatör ve patojen mikroorganizmalar, gıda muhafaza ilkeleri, gıdalarda mikrobiyolojik bozulmalar (patojen mikroorganizmalar ve muhafaza yöntemleri), gıda güvenliği (biyolojik kriterler ve hızlı mikrobiyolojik yöntemler) konuları işlenecektir.

BY-608                Ekonomik Önemi Olan Bakteriyofajlar

                Bakteriyofaj çeşitleri, bakteriyofajlardan yararlanılan alanlar ve ekonomik alanda bakteriyofajların neden olduğu sorunlar ve bunların çözümüne dönük konular işlenecektir.

BY-610                Bakteriyofaj İzolasyonu ve Faj Vektörü Üretimi

                Enterabacteriaceae üyesi bakterilerin çeşitli şekillerde plak verdiği fajların fecal kirli sulardan izolasyonu ve olası faj-konak karakterlerinin saptanması.

BY-612 Bilgisayarda Biyolojik Veri Değerlendirmesi

                Bilimsel makalelerin bilgisayara girilmesi ( WORD ) verilerin grafiksel ve tablo olarak sunumu (WORD – EXCEL ) ve verilerin istatiksel değrelendirilmeleri     ( SPSS )

BY-614 Deniz Kirliliği

Deniz kirlenmesinin tanımı, deniz kirlenme türlerinin sınıflandırılması, kirletici kaynaklar kirlenme türleri, Organik kirlenme (ötrifikasyon, mikrobiyal kirlenme), Termal kirlenme, Radyoaktif kirlenme, Kimyasal kirlenme (Deterjan kirlenmesi, Pestisit kirlenmesi, Petrol